注文タグで絞込み検索をしてCSV出力することはできますか？

はい。可能です。

①注文管理画面より「絞り込む」をクリックします。
②左側プルダウンより「タグ付け済み」を選択します。
③該当の注文タグ名を入力すると該当注文のみ表示されます。

④絞り込まれた該当注文にチェックを入れます。
⑤「その他の操作」をクリックします。
⑥出力したい配送会社のCSV出力を選択すると、配送マネージャーCSV出力プレビュー画面に遷移します。
※その後の操作は、通常のCSV出力時と同様です。